Por su valor artístico, durante la guerra civil este templo fue protegido por la Generalidad de Cataluña, que evitó su destrucción. Sin embargo, sufrió daños considerables en su fábrica y fueron robados o destruidos algunos objetos de culto. El campanario y las campanas quedaron intactas. La casa rectoral resultó muy maltrecha.
El archivo parroquial pudo ser recuperado en gran parte.
En cuanto a libros sacramentales, se conservan bautismos a partir del año 1539, confirmaciones a partir de 1621, matrimonios de los años 1566-1900 y defunciones de 1388-1900.
Archivo parroquial de la Basílica dels Sants Màrtirs Just i Pastor:
Horario (es necesario pedir cita previa): Martes de 17,00 a 20,00
C. Rera Sant Just s/n
Tel. 93 301 74 33 / 617070937
http://arxiudelabasilicadelssantsmartirsjustipastor.cat/arxiu
Se pueden consultar los microfilms en el Archivo Diocesano de Barcelona Archivos parroquiales microfilmados.